為呼應全人健康、弱勢族群服務及與他校區隔之理念,本所以 (1) 分子細胞醫學 (含分子醫學、生物技術、再生醫學等)、(2) 健康行為與環境 (含健康行為、環境醫學、偏鄉地區健康議題等)及(3) 健康服務 (含健康政策、長照體系、醫療器材創新設計等) 等三大領域作為特色。
依教學理念訂出本所四大教育目標:
本所採循序漸進方式,由初始階段養成研究生基本的研究能力、學習各種實驗技能及研究方法,進而具能力設計實驗以進行更深入的機轉性研究。待研究生已有單獨設計試驗能力之時,將進一步結合中部醫學中心及教學醫院之基礎醫學與臨床醫學研究強項優勢,使學習學生更具寬廣的視野,以落實全人健康理念,進而強化分子細胞醫學、健康行為與環境、健康服務等三大領域特殊需求與特色研究發展。進一步接軌國際臨床醫學研究培育趨勢為目標,推動國際合作臨床醫學教育,規劃國際學生交流及見習等活動,培養研究生之宏觀思維。
 據此,本所學生可獲得之核心能力有下列五項: